В своем ответе министерству настоятельница монастыря игуменья Филарета указала на то, что согласно уставу монастыря, соответствующему требованиям эстонского законодательства, монастырь не имеет права выдвигать предложения о выходе из иерархической структуры Русской православной церкви (РПЦ).
По ее словам, согласно одному из пунктов устава РПЦ, самовольное принятие монастырем нелегитимного решения о выходе из-под юрисдикции РПЦ означает прекращение деятельности монастыря как религиозной организации, и этот пункт распространяется и на Пюхтицкий монастырь.
Игуменья добавила, что согласно уставу монастыря, органами его управления являются патриарх РПЦ, настоятельница и духовный собор.
Она добавила, что лишение монастыря ставропигиального статуса, согласно уставу РПЦ, также может быть инициировано только руководством РПЦ.