Агнесе Калниня начала работу в Министерстве иностранных дел в 2001 году. В ходе карьеры она работала в Юридическом департаменте, руководила Отделом международного права, Отделом контроля экспорта товаров стратегического значения и Департаментом внутренней безопасности, а также была дипломатом в посольстве Латвии в Вашингтоне, в США.
Она получила степень бакалавра социальных наук в политологии и степень магистра права в Латвийском университете, а также пополняла профессиональные знания в Женевском центре политики безопасности, в Венской дипломатической академии и в Академии европейского права в Трире, в Германии.
А. Калниня сменит в должности Вилмарса Хениньша, который являлся послом Латвии в Венгрии с 2016 года.