18 апреля Ходорковский заявил, что в ближайшее время не намерен возвращаться в Россию. «Я планирую вернуться в тот момент, когда негативные последствия для власти от моего немедленного направления в тюрьму будут крайне серьезные», — сказал он.
11 декабря 2015 года Ходорковскому предъявили заочное обвинение в организации убийства. По версии следствия, в период с 1998 по 1999 год бизнесмен поручил подчиненным ему сотрудникам убить мэра Нефтеюганска и предпринимателя Евгения Рыбина. В правоохранительных органах полагают, что их служебная деятельность противоречила интересам ЮКОСа и преступления совершались с корыстными мотивами. Ходорковский свою причастность к этому преступлению отрицает.
Официальный представитель Следственного комитета России (СКР) Владимир Маркин заявил, что обвиняемый бывший глава ЮКОСа не уйдет от наказания под предлогом истечения срока давности.
Национальное бюро Интерпола в России объявило Ходорковского в международный розыск, однако Генеральный секретариат международной организации уголовной полиции отклонил запрос Генпрокуратуры России. 17 мая в Интерпол был направлен новый пакет документов по делу бывшего главы ЮКОСа.
Ходорковского, который отбыл в заключении десять лет по делам ЮКОСа, помиловали в декабре 2013 года. Вскоре он покинул страну и получил вид на жительство в Швейцарии.