Друзья и родственники нашли Глушкова мертвым в его доме в Лондоне вечером в понедельник, 12 марта, сообщили The Guardian источники в его окружении. Причина смерти неизвестна. Глушкову было 68 лет.
Первое дело Генпрокуратура возбудила в 1999 году. По этому делу обвинения предъявили Березовскому, Глушкову, еще одному замгендиректора авиакомпании Александру Красненкеру и другим менеджерам компании. По версии следствия, Березовский как акционер «Аэрофлота» добился назначения близких ему людей на ключевые должности в компании, а затем фигуранты дела, организовав проведение финансовых потоков «Аэрофлота» через швейцарскую фирму Andava с выплатой ей процентов, похитили у компании 214,9 миллиона рублей из валютной выручки перевозчика. В марте 2004 года Савеловский суд признал Глушкова виновным только в злоупотреблении полномочиями, и его освободили из-под стражи. Обе стороны оспорили решение суда, Мосгорсуд направил дело на новое рассмотрение.
Летом 2006 года Савеловский суд признал Глушкова и еще двоих обвиняемых виновными в хищении 214,9 миллиона рублей у перевозчика и дал им условные сроки. Красненкер в 2005 году умер.
Глушков затем покинул Россию и обосновался в Великобритании. В марте 2017 года Савеловский суд уже заочно признал его виновным в хищении 123 миллиона долларов у «Аэрофлота» в 90-х годах через подконтрольную Березовскому компанию Forus. Суд приговорил его к восьми годам колонии и штрафу в один миллион рублей.
Борис Березовский умер в Великобритании 23 марта 2013 года в возрасте 67 лет.