Поправки предусматривают, что, если на территории реализации проекта "Rail Baltica" или в его защитной зоне находится памятник культуры, то Министерство сообщения или уполномоченное им лицо, которое отвечает за выявление культурно-исторических ценности, производит фиксацию и оценку этих культурно-исторических ценностей. Документацию и объективно аргументированное обоснования исключения памятника культуры Министерство сообщения или уполномоченное им лицо затем подает в Управление национальным культурным наследием.
Само решение об исключении памятника культуры из списка принимает уже Кабинет министров по инициативе Министерства сообщения, выяснив мнение Управления национальным культурным наследием и консультируясь с самоуправлением, на территории которого находится памятник.
Правительство исключит памятник культуры из списка, если при реализации проекта создания железндорожной инфраструктуры, нет возможности соединить существование памятника с "Rail Baltica", а также, если памятник нельзя перенести в другое место или как минимум частично сохранить.
В случае, если будет принято решение исключить памятник из списка охраняемых государством объектов, Управление национальным культурным наследием установит условия исследования и изучения памятника или его ценных частей, демонтажа и сохранения фрагментов.